В апреле 1996 года в районе аула Гехи-Чу был убит в ходе спецоперации первый президент Чечни, генерал-майор авиации Советской Армии Джохар Дудаев. Во время разговора генерала Дудаева по спутниковому телефону был запеленгован спецсредствами радиосигнал и определено место, откуда работал источник радиосигнала. Далее по этому месту были выпущены авиационные высокоточные ракеты, которые и взорвали Дудаева.
В июне 2001 года вместе с 17 боевиками из своего ближнего окружения уничтожен в ходе операции в районе чеченского селения Ермоловка полевой командир Арби Бараев, который "прославился" особой жестокостью к пленным. Во второй чеченской войне в горном Шатойском районе специальные отряды Бараева насчитывали до 1000 боевиков.
В июле 2001 года в ходе спецоперации федеральных войск уничтожен полевой командир Ризван Ахмадов, который являлся одним из самых влиятельных полевых командиров второй чеченской войны. Именно он подозревался ФСБ РФ в похищении сотрудника международной организации "Врачи без границ" Кеннета Глака в январе 2001 года.
В январе 2002 года в тюрьме умер, по официальной версии, от кровоизлияния в мозг полевой командир Салман Радуев. В марте 2000 года он в ходе спецоперации был захвачен в плен сотрудниками ФСБ. По статьям "терроризм", "убийство с особой жестокостью", "похищения людей", "разбой", "организация незаконных вооруженных формирований" суд Республики Дагестан приговорил Радуева к пожизненному заключению с отбыванием наказания тюрьме с особым режимом содержания, где внешне здоровый Радуев через несколько месяцев неожиданно умер.
В марте 2002 года в ходе спецоперации федеральных войск уничтожен один из основных лидеров незаконных вооруженных формирований арабский наемник Хаттаб. Именно через него шло масштабное финансирование боевиков. Под его руководством действовали лагеря для обучения бандитов ведению партизанской войны в России, диверсиям и террористическим актам.
В феврале 2004 года в Катаре уничтожен исполняющий обязанности президента Чечни Зелимхан Яндарбиев. Он убит в результате подрыва заминированного автомобиля. Бывший вице-президент самопровозглашенной Республики Ичкерия, активный сподвижник Джохара Дудаева, проповедник развития религиозного экстремизма на Северном Кавказе нашел политическое убежище в городе Дохе, столице государства Катар. Российские власти как международного преступника объявили Яндарбиева в федеральный и международный розыск и несколько лет добивались от властей Катара его выдачи в руки российского правосудия.
В феврале 2004 года в Дагестане был убит полевой командир Руслан Гелаев. До чеченских войн Гелаев "прославился" на своей родине уголовными похождениями. В первую чеченскую войну командовал боевиками в центральных районах Грозного. Был командиром полка специального назначения. Уничтожен Гелаев в бою дагестанскими пограничниками.